Le conseil d'administration de la Corporation joue le rôle de table de concertation multisectorielle. Il est composé de 31 personnes issues de l'Assemblée générale qui compte plus de 350 organismes membres. Les tâches et décisions administratives et exécutives sont déléguées à un comité exécutif de cinq personnes. Différents comités de travail multisectoriels, permanents ou ad hoc, ont été mis en place pour traiter certains dossiers particuliers. À l’occasion, pour certains projets spécifiques subventionnés, des comités de projet sont formés pour en superviser la réalisation. Les 31 sièges du conseil d’administration représentent :18 membres corporatifs réguliers ; 1 membre citoyen ; 1 membre coopté ; 11 membres corporatifs conseillers.
Seuls les membres corporatifs réguliers, les membres citoyens et les membres cooptés sont considérés administrateurs, ont le droit de vote au conseil d’administration et sont éligibles à un poste d’officier. Ceux-ci proviennent de divers secteurs d’activité (municipal, communautaire, économique, enseignement, environnement, etc.) représentatifs des activités ayant cours sur le territoire. Les membres corporatifs agissant à titre de conseillers sont, quant à eux, constitués d’intervenants de différents ministères, ainsi que des représentants de chacun des comités locaux de l’eau.
Les officiers de l'OBVNEBSL (conseil exécutif) sont:
M. Francis Gagné, Président
M. Judes Côté, 1er Vice-président
M. Étienne Bachant, 2e Vice-président
Mme Gwendoline Tommi-Morin, Secrétaire